مطهری تأکید کرد: امروز متأسفانه درست عمل نمی کنیم و افرادی را صرف اظهار نظر بازداشت و محاکمه می کنیم؛ در حالی که سیره امیرالمؤمنین(ع) این است که تا وقتی دست به سلاح نبرده اند نباید با آنها مقابله کرد.
مطهری گفت: حتی اگر کسی معتقد به براندازی باشد، تا زمانی‌که اقدام عملی مانند کار مسلحانه از او سر نزده است، مجاز به بازداشت او نیستیم و این روشی است که از امام علی (ع) در برخورد با مخالفانش آموخته‌ایم.
تصویب طرح «اصلاح قانون تشکیلات و آیین دادرسی دیوان عدالت اداری» توسط مجلس موجب آن است که در وهله نخست، مجلس به دست خود زمینه ورود سایر نهاد‌ها به فرآیند قانون‌گذاری را فراهم کرده است.
محمدعلی بصیری فردی است که در شامگاه ۱۱ اردیبهشت ۱۳۵۸ از فاصله حدود دو متری با اسلحه رولور به استاد مرتضی مطهری شلیک کرد و این «حاصل عمر» امام خمینی را به شهادت رساند. بصیری عضو گروه فرقان بود؛ گروهی که حدود یک هفته پس از ترور شهید محمدولی قرنی، دومین عملیات ترور خود را به پایان برد.
مطهری از سخنان وزیرخارجه درباره آزادی نازنین زاغری انتقاد کرد. علی مطهری نوشت: وزیر امور خارجه گفته ان « آزادی نازنین زاغری ارتباطی با دریافت پولمان از انگلیس نداشت، با نگاه انسانی صورت گرفت» از آدم صادقی مثل ایشان چتین حرفی بعید بود. خوب است جرم زاغری به مردم توضیح داده شود.
علی مطهری نماینده پیشین مجلس گفت "ایران باید در آخرین مرحله احیای برجام روسیه‌هراسی را کنار بگذارد و مشکلات باقیمانده را با مذاکره مستقیم با مریکا حل‌وفصل کند".
علی مطهری ، فعال سیاسی و نماینده مردم تهران در مجلس دهم به حمله نظامی روسیه به اوکراین واکنش تندی نشان داد و و از رفتار صداوسیما در قبال تحولات اوکراین گلایه کرد. علی مطهری در تویئتر خود نوشت: