سیدمحمدخاتمی در سفر به شهر یزد از آتشکده زرتشتیان یزد دیدن کرد. وی ضمن در این دیدار ضمن گفتگو با زرتشتیان و گردشگران حاضر پس از استماع فلسفه نیایش زرتشتیان در مقابل آتش مقدس با اشاره به خدمات زرتشتیان به ایران، اظهار داشت: نیاز اساسی جامعه امروز ما میهن دوستی و تلاش برای اعتلای ایران است. وی افزود هر انسان منصفی که بخواهد از ایران و تاریخ آن سخن بگوید نمی‌تواند نقش زرتشتیان را نایدیده بگیرد.