مسجد سید اصفهان، بزرگترین مسجد قاجاری این شهر، به دستور آیتالله سیدمحمدباقر شفتیرشتی در محله بیدآباد ساخته شد. روایتها آغاز ساخت آن را میان سالهای ۱۱۸۰ تا ۱۲۴۵ هجری قمری دانستهاند؛ زمینی که پیشتر به همت اعتمادالدوله وزیر شاه سلطان حسین برای مسجد خریداری شده بود، اما در هجوم افغانها بیسرانجام ماند.