رئیس قوه قضائیه در نامهای به رهبر معظم انقلاب اسلامی اجازه خواست تا در زمان باقیمانده تا آغاز به کار دولت جدید، در تمهید مقدمات استقرار دولت سیزدهم متمرکز شود.
آیت الله علی خامنه ای رهبر انقلاب برای اولین بار پس از انتخابات ریاست جمهوری اخیر در جریان دیدار با مدیران قوه قضائیه با ابراهیم رئیسی فرمودند: حضور در میان مردم از نقاط قوت آقای رئیسی است، این مورد را ترک نکنید و مسئولان قوه نیز این مورد را ترک نکنند.
بهمناسبت سالروز میلاد با سعادت حضرت امام علیبنموسیالرضا علیهالسلام و هفته قوه قضائیه، رهبر انقلاب اسلامی با عفو یا تخفیف و تبدیل مجازات پنج هزار و یکصد و پنجاه و شش تن (۵۱۵۶) از محکومان محاکم عمومی و انقلاب، سازمان قضایی نیروهای مسلح و تعزیرات حکومتی موافقت کردند.
رهبر انقلاب فرمودند: میلاد حضرت علیبنموسیالرضا را تبریک میگویم به همه مشتاقان زیارت آن بزرگوار که متأسفانه مدتهاست همه از این فیض بزرگ محروم ماندهایم.
رهبر معظم انقلاب اسلامی در پیامی پیروز بزرگ انتخابات را ملت ایران دانستند و با تأکید بر اینکه نه گلایه از دشواری معیشت، نه مخالفخوانیها با انگیزه دلسرد کردن مردم و نه عواملی مانند تهدید بیماری فراگیر و برخی اختلالها در آغاز ساعات اخذ رأی نتوانست بر عزم ملت فائق بیاید، خطاب به منتخبان مردم در مسئولیت والای ریاست جمهوری یا عضویت شوراها، گفتند: فرصت خدمتگزاری به کشور و ملت را قدر بدانید و انگیزههای خدائی را همواره مدّ نظر داشته باشید.
رهبر انقلاب پس از حضور در انتخابات فرمودند: روز انتخابات روز ملت ایران است. امروزمیداندار و صحنهگردان اصلی مردمند. مردم هستند که با حضور در پای صندوقهای رأی و با دادن رأی در واقع تکلیف کلی و اساسی کشور را برای سالهای آینده معین میکنند. امروز متعلق به مردم است؛ و هرکاری که ملت ایران امروز تا شب انجام دهند از حضور در صندوق و دادن رأی این سازنده آینده ایران است. تعیین کننده سرنوشت چندساله ایران است. درست به همین دلیل است که خرد حکم میکند که در این آزمون ملی و سراسری همه شرکت کنند.
رهبر معظم انقلاب گفتند: امروز میداندار و صحنهگردان اصلی مردم هستند که با رأی خود سرنوشت و تکلیف کلی و اساسی کشور را برای سالهای بعد معین میکنند بنابراین امروز متعلق به مردم است.
صفحه اینستاگرام حضرت آیتالله خامنهای با اشاره به تاکید ایشان بر مشارکت حداکثری در انتخابات به بازخوانی سخنان رهبر انقلاب درباره تأثیر تک تک آرای مردم پرداخت.
بعد از اعلام نتایج بررسی صلاحیت نامزدهای انتخابات ریاست جمهوری ۱۴۰۰، بعضی انتظار ورود مستقیم رهبر انقلاب به موضوع را داشتند. اما از نظر رهبر انقلاب، حجتی برای ورود به این مساله و مصادیق آن وجود نداشته است. ایشان حتی در پاسخ به درخواست شورای نگهبان نسبتبه صلاحیت داوطلبان هم صریحا عنوان داشتهاند که بنای دخالت ندارند.