عطریانفر به اخبار منتشر شده درباره ارسال پیام رهبر انقلاب به سیدمحمد خاتمی پرداخت و گفت: «تا آنجا که اطلاع دارم، اصل ماجرا رخ داده است. پس از انتخاب آقای مجتبی خامنهای، آقای خاتمی پیام تبریکی برای ایشان ارسال کردند و متقابلاً نیز پاسخ محترمانه و هوشمندانهای از سوی رهبری برای ایشان فرستاده شد»
در پیام رهبر انقلاب آمده است: «جا دارد به همین مناسبت از حضور دهها میلیونی، اعجاببرانگیز، دشمنشکن و تاریخی مردم در شهرها و روستاهای ایران و عراق خصوصاً تهران، قم، نجف، کربلا، و مشهد صمیمانه قدردانی کنم.»
درحالی که ستاد مراسم بدرقه و تشییع رهبر شهید انقلاب اعلام کرده است که در هر شهر یک «مرجع تقلید» نماز میت را اقامه خواهد کرد. نیویورک تایمز از احتمال حضور آیتالله سید مجتبی خامنهای در مراسم خاکسپاری و اقامه نماز میت خبر داده است.
یحیی رحیم صفوی فرمانده سپاه گفت: امیدواریم حضرت آیتالله سید مجتبی همانگونه که رهبر شهید راه امام را با صلابت و اقتدار ادامه دادند، مسیر پدر بزرگوارشان را با قدرت، مردمداری، حفظ ایران قوی، دور نگه داشتن سایه جنگ از کشور، پیشرفت و آبادانی و مردم از حکومت راضی باشند، ادامه دهند.
آیت الله سیدمجتبی خامنهای از حضور در رسانهها پرهیز دارند و تنها مورد استثنایی، مصاحبهای است که در آستانۀ برگزاری نکوداشت پدر بزرگ مرحوم شان آیتالله سیّدجواد خامنهای انجام دادهاند.
رهبر انقلاب اسلامی در پیامی با تاکید بر ضرورت پیگیری خون شهدای جنگ تحمیلی دوم و سوم، تصریح کردند: جنایات جنگی بیسابقه در میناب و لامِرد، حمله به مراکز درمانی و خدماتی، کشتار نوزادان چندروزه و کهنسالان و شهادت رهبر شهید انقلاب هرکدام پروندهای از صدها و بلکه هزاران پرونده حقوقی است که در محاکم قضائی داخلی و بینالمللی باید با جدّیت دنبال شود.
حضرت آیتالله سیدمجتبی حسینی خامنهای رهبر انقلاب اسلامی با درخواست رییس قوه قضاییه برای عفو یا تخفیف و تبدیل مجازات دو هزار نفر از محکومان محاکم به مناسبت عید سعید غدیر خم موافقت کردند.
رهبر انقلاب به مناسبت عید غدیر و سی و هفتمین سالگرد ارتحال حضرت امام خمینی (ره) و سالگرد آغاز رهبری حضرت آیتالله شهید سیدعلی خامنهای پیامی منتشر کردند.